ChIP-seq
是将染色质免疫共沉淀技术与二代测序技术相结合,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化及文库构建,对富集到的DNA片段进行高通量测序。高效地在全基因组范围内检测与组蛋白,转录因子等互作的DNA区段。
RIP-seq
RIP-seq(RNA免疫沉淀结合高通量测序)通过免疫沉淀目的蛋白来捕 获蛋白体内结合的RNA,将捕获的RNA进行高通量测序,可获得RNA结合蛋白(RBP)在体内与众多RNA靶标的结合模式及其结合强度。最终通过分析目的蛋白在体内结合RNA的动态变化,阐述出目的蛋白对基因表达调控的分子机制。